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在进行烟囱防腐前首先要搞清楚的是烟囱使用的现有损伤情况和实际承载力状态，对烟囱目前的安全性、可靠性、耐久性进行全面的评估。最终制定出科学的防腐施工方案及防腐材料的选择。
烟囱防腐存在问题的严重性主要表现在三个方面：
1、涉及面广
目前我国脱硫烟囱所采用的防腐方案中很多方案由于防腐材料本身的质量、施工质量等原因造成烟囱防腐出现过不同程度的损坏现象。
2、比例高
出现开裂、冲刷或脱落、酸液渗漏等问题较严重的有：国产泡沫玻璃砖、玻璃鳞片、0M涂料以及耐酸胶泥砲筑耐酸砖内筒等。
3、时间短
根据相关规范的规定，烟囱结构应满足设计基准期50年要求，排烟功能设计应满足工艺系统设计寿命30年的要求。但有的工程仅投运2个月即发现由于泡沫玻璃砖脱落对钢内筒造成严重腐蚀；有的脱硫改造单筒烟囱工程项目投运后仅4个月即发生酸液沿烟囱外筒壁渗漏，造成对钢筋混凝土筒身腐蚀。
烟囱防腐工程现有问题的主要原因
1、施工质量没有满足相关设计、施工和验收规范，特别是对于粘贴防腐块材类的，由于粘贴量大，且高空作业，加之监理旁站等措施不到位，这是导致脱硫烟囱防腐出现问题的主要原因。
2、部分防腐材料本身的质量不能满足脱硫后烟气环境的要求，目前我国应用于脱硫烟囱防腐的产品种类繁多，防腐产品的研发、应用及其成果的评审与鉴定等组织机构宽泛，难免鱼目混珠，以致使防腐产品质量存在问题。
3、发电企业对脱硫烟囱防腐的认识和重视程度不够，没有将脱硫烟囱防腐纳人到脱硫设备管理的范畴，低价中标及不合理的工期要求十分普遍，且疏于巡检，导致部分脱硫烟囱防腐一旦发现问题即对机组运行带来影响，甚至危及烟囱结构安全。
目前用于烟囱防腐的防腐材料比较的的，如镍基合金、钛钢复合板、FRP玻璃钢、耐硫酸露点腐蚀钢板、泡沫玻璃砖（包括进口和国产）、泡沫玻化砖、烟囱专用防腐涂料、APC杂化聚合结构层、耐酸耐热整体浇筑料等，这些材料各有其优缺点，在工程选用中应结合烟囱防腐施工方案进行选择。